Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sfta2E9PXB6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms