Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms