Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3252E9PUT9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms