Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms