Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms