Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms