Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf217D3YYI7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Rnf217D3YYI7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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