Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfap1aC0HKD8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms