Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms