Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms