Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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