Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms