Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms