Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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