Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samt1A2BED8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms