Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rtf1A2AQ19 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms