Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms