Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms