Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm27029A2A4P4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm27029A2A4P4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms