Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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