Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms