Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms