Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms