Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms