Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms