Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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