Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms