Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms