Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Chst4Q9R1I1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms