Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms