Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms