Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms