Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms