Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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