Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms