Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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