Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dclk1Q9JLM8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclk1Q9JLM8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms