Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnfrsf19Q9JLL3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfrsf19Q9JLL3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms