Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg3Q9JL95 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prg3Q9JL95 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prg3Q9JL95 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prg3Q9JL95 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prg3Q9JL95 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg3Q9JL95 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg3Q9JL95 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg3Q9JL95 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.8 ms