Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms