Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms