Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ap3m1Q9JKC8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms