Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms