Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gfra4Q9JJT2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gfra4Q9JJT2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gfra4Q9JJT2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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