Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1fQ9JIS7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms