Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim39Q9ESN2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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