Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
OtofQ9ESF1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
OtofQ9ESF1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
OtofQ9ESF1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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