Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ush1cQ9ES64 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms