Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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