Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms